Паломническая служба Общества существует с 2000 г. В паломнических поездках по святым местам участвуют православные врачи и болящие, которые приходят в Душепопечительский центр Общества, а также члены их семей.

Поездки в основном носят однодневный характер, чтобы больные не переутомлялись. Группу пациентов всегда сопровождает врач. В программу поездки обычно входят молебен и прикладывание к мощам святых, погружение в святой источник, участие в богослужении.

Периодически совершаются и многодневные поездки, в основном для духовного укрепления врачей. За последние четыре года они проводились по следующим святым местам: Дивеево, Владимир, Боголюбово, Муром, Введено-Оятский женский монастырь, о. Валаам, Заянье, Лосицы, святые источники Псковской Епархии, мужской монастырь прп. Александра Свирского, Москва, Троице-Сергиева Лавра, святые места Новгородской епархии, Варлаамо-Хутынский женский монастырь,Свято-Успенский Пюхтицкий ставропигиальный женский монастырь, о. Соловки, Киев, Почаевская Лавра, Екатеринбургская епархия и др.

Следует отметить, что паломнические поездки являются третьим направлением реализации практических задач Общества православных врачей, во время которых воцерковляются и духовно укрепляются врачи, происходит один из этапов реабилитации оккультнопораженных людей, проводится диспансеризация православных поселений и общин.

В отличие от классических паломнических поездок, поездки ОПВ имеют специфический характер. В поездке находятся сугубо больные люди и сопровождающие их врачи члены ОПВ. Учитывая повышенную утомляемость пациентов Душепопечительского Центра, большинство поездок носит краткосрочный (одно-двухдневный) характер, с обязательным посещением чудотворного источника и обязательным молебном перед мощами святых угодников Божиих. Приобщение к святыням православной церкви является одним из главных звеньев душепопечения оккультнопораженных, алкоголиков и наркозависимых лиц. За последние годы в паломнических поездках побывало около 2000 человек.